Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ptpn1P35821 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms