Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ddit3P35639 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ddit3P35639 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms