Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp4P35123 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp4P35123 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms