Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Psmb9P28076 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms