Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PdgfraP26618 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PdgfraP26618 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.6 ms