Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChgaP26339 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChgaP26339 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ChgaP26339 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChgaP26339 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChgaP26339 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChgaP26339 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ChgaP26339 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms