Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hoxd12P23812 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd12P23812 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms