Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja1P23242 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja1P23242 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja1P23242 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja1P23242 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gja1P23242 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gja1P23242 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms