Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Ntf3P20181 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms