Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ifrd1P19182 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ifrd1P19182 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms