Protein–RNA interactions for Protein: P18532

Ig heavy chain V region 1B43, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18532 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
P18532 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
P18532 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
P18532 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18532 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18532 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18532 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18532 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18532 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18532 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18532 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
P18532 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms