Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnaP17918 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnaP17918 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnaP17918 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcnaP17918 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms