Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pou4f1P17208 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pou4f1P17208 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou4f1P17208 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pou4f1P17208 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pou4f1P17208 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou4f1P17208 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou4f1P17208 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou4f1P17208 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pou4f1P17208 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms