Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Pinx1-201ENSMUST00000022528 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Olfr1233-201ENSMUST00000099784 1042 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxb4P10284 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms