Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04214 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04214 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04214 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04214 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04214 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04214 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04214 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04214 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04214 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04214 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04214 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04214 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04214 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04214 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04214 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04214 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04214 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P04214 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04214 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04214 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P04214 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04214 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04214 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04214 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04214 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04214 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04214 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04214 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04214 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04214 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P04214 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04214 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04214 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04214 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04214 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P04214 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04214 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04214 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04214 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04214 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04214 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04214 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04214 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04214 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04214 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04214 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P04214 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04214 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04214 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04214 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P04214 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P04214 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04214 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04214 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04214 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04214 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04214 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04214 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04214 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04214 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04214 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04214 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04214 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04214 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P04214 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04214 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04214 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04214 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04214 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04214 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P04214 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P04214 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04214 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04214 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P04214 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04214 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04214 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04214 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04214 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04214 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04214 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04214 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04214 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04214 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04214 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P04214 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04214 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04214 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04214 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04214 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04214 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04214 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04214 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04214 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04214 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04214 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04214 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P04214 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04214 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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