Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01641 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01641 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01641 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01641 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01641 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01641 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01641 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01641 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01641 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01641 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01641 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01641 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01641 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01641 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01641 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01641 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01641 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01641 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01641 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01641 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01641 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01641 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01641 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01641 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01641 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01641 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01641 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
P01641 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01641 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01641 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01641 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01641 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01641 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01641 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01641 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01641 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01641 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01641 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01641 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01641 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
P01641 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01641 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01641 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01641 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01641 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01641 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01641 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
P01641 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01641 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01641 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01641 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01641 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01641 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01641 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01641 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
P01641 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01641 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01641 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01641 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01641 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01641 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01641 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01641 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01641 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
P01641 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01641 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms