Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Casp8O89110 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms