Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Ccl20O89093 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ccl20O89093 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ccl20O89093 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccl20O89093 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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