Protein–RNA interactions for Protein: O88705

Hcn3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn3O88705 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hcn3O88705 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Hcn3O88705 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms