Protein–RNA interactions for Protein: O88696

Clpp, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClppO88696 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClppO88696 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClppO88696 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClppO88696 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
ClppO88696 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ClppO88696 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ClppO88696 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
ClppO88696 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
ClppO88696 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
ClppO88696 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ClppO88696 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClppO88696 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClppO88696 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClppO88696 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClppO88696 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClppO88696 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClppO88696 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClppO88696 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClppO88696 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClppO88696 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ClppO88696 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClppO88696 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClppO88696 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClppO88696 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClppO88696 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClppO88696 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClppO88696 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClppO88696 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClppO88696 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClppO88696 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClppO88696 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClppO88696 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClppO88696 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ClppO88696 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ClppO88696 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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