Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
CntfrO88507 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms