Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ctnnal1O88327 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ctnnal1O88327 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms