Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Syngr1O55100 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Syngr1O55100 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms