Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn6O35646 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn6O35646 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn6O35646 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn6O35646 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn6O35646 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn6O35646 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn6O35646 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn6O35646 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Capn6O35646 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms