Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Opn1mwO35599 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms