Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk4O35493 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk4O35493 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk4O35493 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk4O35493 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk4O35493 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk4O35493 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk4O35493 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clk4O35493 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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