Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Foxd2O35392 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Foxd2O35392 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms