Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc18a3O35304 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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