Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ptpn9O35239 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ptpn9O35239 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Ptpn9O35239 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ptpn9O35239 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ptpn9O35239 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptpn9O35239 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ptpn9O35239 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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Ptpn9O35239 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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Ptpn9O35239 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ptpn9O35239 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ptpn9O35239 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Ptpn9O35239 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptpn9O35239 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms