Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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Kcns1O35173 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Kcns1O35173 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
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Kcns1O35173 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Kcns1O35173 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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