Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Cldn4O35054 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cldn4O35054 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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