Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NumblO08919 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NumblO08919 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NumblO08919 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NumblO08919 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NumblO08919 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NumblO08919 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NumblO08919 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NumblO08919 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NumblO08919 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NumblO08919 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NumblO08919 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NumblO08919 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NumblO08919 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NumblO08919 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NumblO08919 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NumblO08919 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NumblO08919 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NumblO08919 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NumblO08919 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NumblO08919 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NumblO08919 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NumblO08919 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NumblO08919 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NumblO08919 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NumblO08919 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NumblO08919 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NumblO08919 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NumblO08919 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NumblO08919 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NumblO08919 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NumblO08919 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NumblO08919 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NumblO08919 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NumblO08919 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NumblO08919 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NumblO08919 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NumblO08919 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NumblO08919 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NumblO08919 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NumblO08919 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NumblO08919 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NumblO08919 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NumblO08919 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
NumblO08919 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NumblO08919 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NumblO08919 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NumblO08919 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NumblO08919 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NumblO08919 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NumblO08919 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NumblO08919 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NumblO08919 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NumblO08919 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NumblO08919 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NumblO08919 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NumblO08919 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NumblO08919 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NumblO08919 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NumblO08919 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NumblO08919 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NumblO08919 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NumblO08919 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NumblO08919 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NumblO08919 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NumblO08919 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NumblO08919 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NumblO08919 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NumblO08919 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms