Protein–RNA interactions for Protein: O08856

Ell, RNA polymerase II elongation factor ELL, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EllO08856 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
EllO08856 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
EllO08856 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
EllO08856 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EllO08856 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EllO08856 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EllO08856 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EllO08856 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EllO08856 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EllO08856 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EllO08856 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EllO08856 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EllO08856 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EllO08856 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EllO08856 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EllO08856 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EllO08856 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EllO08856 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EllO08856 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EllO08856 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EllO08856 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EllO08856 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EllO08856 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EllO08856 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
EllO08856 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EllO08856 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EllO08856 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EllO08856 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EllO08856 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EllO08856 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
EllO08856 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
EllO08856 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EllO08856 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms