Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Eftud2O08810 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms