Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube3aO08759 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube3aO08759 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube3aO08759 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube3aO08759 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube3aO08759 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube3aO08759 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube3aO08759 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube3aO08759 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube3aO08759 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube3aO08759 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube3aO08759 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ube3aO08759 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube3aO08759 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube3aO08759 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube3aO08759 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube3aO08759 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube3aO08759 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube3aO08759 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube3aO08759 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube3aO08759 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube3aO08759 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube3aO08759 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ube3aO08759 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ube3aO08759 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms