Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccer2J3QPU5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ccer2J3QPU5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms