Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm5294J3QP53 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Gm5294J3QP53 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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