Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Fam240aJ3QNP9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms