Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm17577J3QNF7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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