Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm21818J3KMS6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21818J3KMS6 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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