Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Cldn20G5E8X0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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