Protein–RNA interactions for Protein: G3X996

Zfp846, RIKEN cDNA 2210010B09, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp846G3X996 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp846G3X996 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.5 ms