Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
XntrpcF8VQM8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms