Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atf6F6VAN0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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