Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm28305F6U473 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms