Protein–RNA interactions for Protein: F6SG70

Gm28374, Predicted gene 28374 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28374F6SG70 Gm26226-201ENSMUST00000082509 116 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
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Gm28374F6SG70 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 AV099323-201ENSMUST00000124336 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Gm28374F6SG70 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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