Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.47
BC067074F6RXI4 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
BC067074F6RXI4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms