Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ankrd35E9Q9D8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms