Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Urb2E9Q7L1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Urb2E9Q7L1 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms