Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ttc17E9PVB5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ttc17E9PVB5 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms